Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Znf48Q3US17 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Znf48Q3US17 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Znf48Q3US17 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Znf48Q3US17 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Znf48Q3US17 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znf48Q3US17 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Znf48Q3US17 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Znf48Q3US17 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Znf48Q3US17 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Znf48Q3US17 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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