Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
E130208F15RikQ3UPV3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms