Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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