Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep63Q3UPP8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cep63Q3UPP8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms