Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms