Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrc4Q3UP24 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrc4Q3UP24 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrc4Q3UP24 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrc4Q3UP24 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrc4Q3UP24 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nlrc4Q3UP24 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrc4Q3UP24 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrc4Q3UP24 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrc4Q3UP24 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrc4Q3UP24 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nlrc4Q3UP24 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc4Q3UP24 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nlrc4Q3UP24 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms