Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hdgfl2Q3UMU9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms