Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cog7Q3UM29 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms