Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc2Q3ULD5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mccc2Q3ULD5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms