Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpr55Q3UJF0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms