Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b2Q3UJB0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sf3b2Q3UJB0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms