Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnep1r1Q3UJ81 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms