Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc58Q3UGP9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc58Q3UGP9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms