Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zyg11bQ3UFS0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zyg11bQ3UFS0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms