Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Puf60Q3UEB3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Puf60Q3UEB3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms