Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trafd1Q3UDK1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms