Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pid1Q3UBG2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pid1Q3UBG2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pid1Q3UBG2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pid1Q3UBG2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pid1Q3UBG2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pid1Q3UBG2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pid1Q3UBG2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pid1Q3UBG2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pid1Q3UBG2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pid1Q3UBG2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pid1Q3UBG2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pid1Q3UBG2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pid1Q3UBG2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pid1Q3UBG2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pid1Q3UBG2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms