Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rnf166Q3U9F6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rnf166Q3U9F6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rnf166Q3U9F6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rnf166Q3U9F6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rnf166Q3U9F6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rnf166Q3U9F6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rnf166Q3U9F6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rnf166Q3U9F6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms