Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmf1Q3U3R4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmf1Q3U3R4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms