Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccndbp1Q3TVC7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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