Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccdc136Q3TVA9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ccdc136Q3TVA9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc136Q3TVA9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms