Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CiartQ3TQ03 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms