Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc27Q3TKY6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc27Q3TKY6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms