Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms