Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc13Q3TIR1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc13Q3TIR1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms