Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hs1bp3Q3TC93 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hs1bp3Q3TC93 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms