Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9Z9

Zufsp, Zinc finger with UFM1-specific peptidase domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZufspQ3T9Z9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZufspQ3T9Z9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZufspQ3T9Z9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms