Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb33Q30KN3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defb33Q30KN3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms