Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp8Q2V6D6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp8Q2V6D6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms