Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm1Q2TV84 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm1Q2TV84 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms