Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ush2AQ2QI47 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms