Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vax1Q2NKI2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax1Q2NKI2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms