Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom4Q1W617 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Shroom4Q1W617 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shroom4Q1W617 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shroom4Q1W617 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shroom4Q1W617 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shroom4Q1W617 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shroom4Q1W617 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shroom4Q1W617 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Shroom4Q1W617 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shroom4Q1W617 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shroom4Q1W617 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shroom4Q1W617 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shroom4Q1W617 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shroom4Q1W617 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shroom4Q1W617 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Shroom4Q1W617 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms