Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim71Q1PSW8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim71Q1PSW8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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