Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Gli2Q0VGT2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gli2Q0VGT2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms