Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp4r2Q0VGB7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4r2Q0VGB7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms