Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc162pQ0VG85 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc162pQ0VG85 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms