Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim24Q0VG18 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms