Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Ttc39dQ0VF76 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttc39dQ0VF76 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Ttc39dQ0VF76 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Ttc39dQ0VF76 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Ttc39dQ0VF76 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Ttc39dQ0VF76 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Ttc39dQ0VF76 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Ttc39dQ0VF76 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc39dQ0VF76 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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