Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd12Q0VE29 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms