Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rundc1Q0VDN7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms