Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrriq1Q0P5X1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrriq1Q0P5X1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrriq1Q0P5X1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms