Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata18Q0P557 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Spata18Q0P557 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Spata18Q0P557 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata18Q0P557 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Spata18Q0P557 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata18Q0P557 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata18Q0P557 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata18Q0P557 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata18Q0P557 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata18Q0P557 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata18Q0P557 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata18Q0P557 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms