Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kndc1Q0KK55 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kndc1Q0KK55 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms