Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttc21bQ0HA38 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ttc21bQ0HA38 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc21bQ0HA38 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms