Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Znf541Q0GGX2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf541Q0GGX2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms