Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700061G19RikQ08EE8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms