Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbp2Q08652 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp2Q08652 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms