Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tff1Q08423 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff1Q08423 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tff1Q08423 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff1Q08423 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff1Q08423 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tff1Q08423 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff1Q08423 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff1Q08423 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff1Q08423 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff1Q08423 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tff1Q08423 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff1Q08423 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff1Q08423 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff1Q08423 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff1Q08423 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tff1Q08423 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff1Q08423 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tff1Q08423 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff1Q08423 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff1Q08423 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff1Q08423 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tff1Q08423 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tff1Q08423 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tff1Q08423 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tff1Q08423 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms