Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gata4Q08369 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms